真正的BOSS是无界(MUKAI)。
上图的这个只是小BOSS是艾黛儿海德。
见到大BOSS无界的 是：在对黑色的草薙京的时候最后用超必杀技（或队长超必杀）将其击败
这样在最后就不是去飞艇上见艾黛尔海德，而是去打神乐双子：
打完神乐双子，大BOSS无界（MUKAI）登场：
没有无界的话，就无法和以后的拳皇11和拳皇13的剧情联系起来！！！
拳皇2003有2个最终boss，一个是艾迪尔海德·伯恩斯坦（卢卡尔的儿子），另一个是无界（遥彼系列的人物）
打出他们的条件：
第4战面对幻の草薙京，如果用消耗能量的攻击（换人攻击也算的）打死他，那么最终boss就是无界；反之则是艾迪尔海德·伯恩斯坦。
而游戏的结局乃至官方完整队伍结局则必须击败无界后才能看到；若最终boss是艾迪尔海德·伯恩斯坦，那么打倒他后直接宣布“game over艾迪尔海德·伯恩斯坦：通关流程最终boss是艾迪尔海德·伯恩斯坦的话，通关后即可解锁艾迪尔海德·伯恩斯坦（在八神庵头像上按R1即可选出）。
无界：通关流程最终boss是无界的话，通关后即可解锁无界（在草薙京头像上按R1即可选出）。神乐千鹤：在任意位置输入↑↖←↙↓↘→↗→↘↓↙+任一键
幻の草薙京：在任意位置输入↓↙←↖←↙↓↘→↗+任一键
注：最后一个方向键要拉住的时候选人
PS2版可直接选择幻の草薙京和神乐双子。
在拳皇2003中，卧虎藏龙的两个BOSS的出招表与拳皇01版本的两个BOSS完全一致。其中，火ZERO的出招表与真ZERO相同，火球则对应伊格尼斯。
真ZERO的普通攻击包括普通投邪骸喰刹近敌，+C和+D按键分别触发不同效果。特殊技幻魔刻翔可通过同时按下+A键实现，该技能用于中段攻击。
库扎利的特殊技库扎利的+A则通过ST呼叫启动，该技能同样具备中段攻击效果。最后一段破防必杀技斩风燕破叛镜+A可反弹飞行道具，斩风燕破杀魔+C与斩风燕破凰牙+A则用于攻击。
斩风燕破翔覇+C则是该BOSS的超必杀技，通过三次斩风燕破组合而成。而火球BOSS伊格尼斯的普通攻击则为普通投蓝红色诺亚近敌，+C和+D按键触发不同效果。
其必杀技鍊刃通过+A/C键触发，用链梭横劈开对手，其他必杀技能取消可能。SuperCancer;C发追击可使用鍊刃颅顶骨棱切开+A/C，这是一种从两手拿出链梭飞上天的对空技。
伊格尼斯的必杀技空间集体屠杀通过+B/D键触发，返技成功时WIRE ATTACK。神圣之箭天空+A可通过+A/C键穿透对手飞行道具，神圣之箭地面+C则可通过+B/D键吸收对手飞行道具再反射。
第一段WIRE ATTACK，第二段击倒，超必杀圣光之刃+A/C通过地面光柱放，追击可使用超必杀混沌状态+B/DMAX超杀蓝色成为神的计划+ABCD乱舞技。
